20 września 2023 roku Komisja Europejska podjęła decyzję nr C (2023)6435 o zmianie programu. Zmiana polega na zwiększeniu jego budżetu o 2,69 mln euro z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego. Dodatkowe środki w całości zostały przeznaczone na obszar tematyczny związany z przystosowaniem do zmian klimatu (Priorytet 1. Przyjazne naturze i bezpieczne Pogranicze).
