Program Interreg Litwa - Polska 2021-2027 został zmieniony decyzją Komisji Europejskiej o numerze C (2023)9146 z 18 grudnia 2023 r. Dokument określa zakres wsparcia w programie. Najważniejsze zmiany dotyczyły:
powiększenia obszaru wsparcia programu o subregion olsztyński i łomżyński;
zwiększenia budżetu programu i alokacji dla wnioskodawców w poszczególnych działaniach programu;
dodania celu szczegółowego „Zarządzanie przejściami granicznymi” w Priorytecie 3;
wprowadzenia nowego Priorytetu 4: „Poprawa łączności”;
aktualizacji informacji dotyczących projektów o znaczeniu strategicznym (Załącznik 3).